成立于2005年8月，由杭州市政府、杭州艾森医药研究有限公司共同建设。

通过两期项目工程建设，已构建了拥有105万种化合物的化合物库，是国家化合物库最大的卫星库。

建立了国内唯一、国际先进的药物心脏毒性高通量筛选子平台和抗肿瘤细胞迁移药物筛选子平台以及全自动高通量药物筛选子平台。

中心利用已建成的高通量靶向筛选模型，可完成50万以上的化合物量筛选，多次承担国家协同筛选工作。